Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms