Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDC3Q96F86 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC3Q96F86 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC3Q96F86 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC3Q96F86 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC3Q96F86 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC3Q96F86 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC3Q96F86 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC3Q96F86 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDC3Q96F86 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms