Protein–RNA interactions for Protein: Q96DV4

MRPL38, 39S ribosomal protein L38, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38Q96DV4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL38Q96DV4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms