Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPTQ96BT3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPTQ96BT3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms