Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DHX38Q92620 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DHX38Q92620 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DHX38Q92620 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DHX38Q92620 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX38Q92620 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms