Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC12Q8WVT3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms