Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms