Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms