Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC2Q8N158 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms