Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP4Q86YS3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP4Q86YS3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms