Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALYREFQ86V81 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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