Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
N4BP2Q86UW6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
N4BP2Q86UW6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms