Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms