Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms