Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms