Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC4Q6P2E9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDC4Q6P2E9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms