Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEPROQ6NW34 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEPROQ6NW34 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms