Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4GALNT3Q6L9W6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
B4GALNT3Q6L9W6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms