Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A4Q6AI14 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms