Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CARMIL1Q5VZK9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms