Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CHIC1Q5VXU3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CHIC1Q5VXU3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms