Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC38Q5VT99 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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LRRC38Q5VT99 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC38Q5VT99 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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