Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRIP1Q5VSL9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms