Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LDLRAD1Q5T700 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms