Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAN3Q58A45 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAN3Q58A45 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms