Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms