Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGO2Q562F6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGO2Q562F6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms