Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRY2Q49AN0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRY2Q49AN0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms