Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF3Q496Y0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms