Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP100Q494V2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms