Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT71Q3SY84 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KRT71Q3SY84 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT71Q3SY84 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms