Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms