Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC96Q2M329 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC96Q2M329 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms