Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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