Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK5Q16478 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK5Q16478 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
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