Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD5Q16401 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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