Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F4Q16254 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms