Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USF2Q15853 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USF2Q15853 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USF2Q15853 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USF2Q15853 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USF2Q15853 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
USF2Q15853 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
USF2Q15853 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
USF2Q15853 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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