Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITSN1Q15811 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITSN1Q15811 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
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