Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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SEC23BQ15437 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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SEC23BQ15437 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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SEC23BQ15437 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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SEC23BQ15437 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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