Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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NR6A1Q15406 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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NR6A1Q15406 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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