Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CLCA4Q14CN2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLCA4Q14CN2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms