Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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DDX39BQ13838 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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DDX39BQ13838 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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