Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHROOM2Q13796 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
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SHROOM2Q13796 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
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SHROOM2Q13796 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
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