Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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