Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PEX6Q13608 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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PEX6Q13608 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PEX6Q13608 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PEX6Q13608 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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PEX6Q13608 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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