Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRQ13535 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRQ13535 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRQ13535 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRQ13535 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRQ13535 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRQ13535 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRQ13535 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRQ13535 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRQ13535 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRQ13535 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRQ13535 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRQ13535 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRQ13535 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRQ13535 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRQ13535 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRQ13535 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRQ13535 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRQ13535 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRQ13535 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRQ13535 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRQ13535 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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