Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF4BQ13523 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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