Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMAD4Q13485 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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