Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDE3BQ13370 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
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